为防止新收获的油菜籽变质、降低出油率，可采取以下方法进行处理。
一、及时整晒
油菜籽脱粒前，应先把油菜秸晒1 遍，脱粒后再抢晴曝晒。晒时要薄摊勤翻，以防籽粒吸热散湿不匀、入库后引起变质。当油菜籽晒至含水量达8%时即可。切忌在柏油路上铺晒油菜籽，以免被污染。检验其含水量是否达到安全贮存标准的方法为： 抓1把油菜籽平摊在桌面上，用瓦片重压，如有脆声表明达到安全贮存标准。
二、清除杂质
曝晒过的油菜籽，通过风扬、筛等办法清除泥沙等杂质。净度鉴别方法是：随手抓1把油菜籽，掌心向上，手指并拢，然后将手倾斜抖动，让油菜籽徐徐下落，如掌心只留下少量灰土，即表明杂质含量符合要求。
三、密闭保管
新收获的油菜籽，如遇阴雨天不能晒时，可将油菜籽装入围囤内，然后用塑料薄膜覆盖，周围地上用泥土压实密封不透气。这样，含水量在20%左右的油菜籽可以保存15天，含水量25%的油菜籽可以保存10天不变质。待天晴后，再抓紧时间曝晒。